参军郭景祥守和州（今安徽和县），有人向朱元璋告发，说他的儿子试图谋杀他，以子谋父，别说是在古代，在现代都是大不孝，对于注重孝道的朱元璋来说绝对不能忍，于是当场就指示，郭景祥的这个儿子必须干掉，这个时候又是马皇后出面出来劝阻，但是马皇后没有直接说告发不实，知道此时此刻说了也没有用，朱元璋气头上不会信，而是先提醒朱元璋郭景祥就这么一个儿子，如果直接听信告发，贸然杀了他，郭家可就绝后了，弑父这么大的事皇上难道都不派人再查证一下，他杀他爹图啥，又不是家里有皇位，朱元璋想了想觉得有道理，于是就派人前往调查，果然发现告发不实。事后，朱元璋感谢马皇后，如果不是她的劝阻，可能就真错杀了郭景祥的儿子。
当时，朱元璋和马皇后的义子兼外甥李文忠镇守严州（今浙江西部），位高权重，有人告发他有不法行为，以李文忠的地位，所谓不法行为就是造反嘛，朱元璋不假思索便立即将他调回，命他移守扬州，扬州距离京师特别近，朱元璋调他回来方便检查。关键时刻，马皇后再次出面，先是提醒朱元璋严州是军事重镇，突然调换大将是不合时宜的，然后又提醒朱元璋，李文忠是他们看着长大的，平日的表现是怎么样的朱元璋难道不知道吗，不可轻信小人的挑拨。朱元璋听后觉得依然有道理，便让李文忠还镇严州，之后李文忠果然立功，不法行为之说不攻自破。