此后，清廷进一步加强了苏北、山东两省，尤其是黄河两岸的防守，以防太平军由扬州直接北上。江南河道总督杨以增已率部驻防清江浦，又令江宁将军托明阿、刑部侍郎奕经等率军增援清江浦、王家营，令署金州副都统杭州将军瑞昌带盛京兵赴淮、徐，会同署四川总督慧成布防。山东巡抚李僡已率部前出江苏宿迁迤北，又令其就近督同兖州镇总兵百胜等统带弁兵，分扼要隘。并知照托明阿、奕经，互相联络，以壮声援。曹州府属之刘家口、董家口等处，也都派兵防守。
当时由南京（江宁）北上的大路，是从浦口渡江，再进入安徽滁州，由定远县、凤阳府渡淮，北至灵璧、宿州分为两路，东北由江苏徐州府渡黄河至山东兖州府界，西北则由河南永城县趋归德府，渡黄河至山东曹州府界。安徽巡抚李嘉端等也曾竭力要求加强对滁州、凤阳一线的防守。但安徽本省仅残存数百兵丁，咸丰帝只得下令截留已入皖境的山东兵、陕甘兵。在得知太平军自浦口、六合“窜扰”至滁、凤一带之后，他更于5月30日下令“统领江北诸军”的钦差大臣琦善统筹兵力，并酌派陈金绶、胜保二人中的一人，“前赴滁州一带剿办”。由于陈金绶年已老迈，琦善“商属”胜保带兵赴皖，咸丰帝于6月9日得知后认为此举“甚妥”，并特许胜保“酌量调拨”兵力，“不必处处札商”。